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TFRC参与调控血管和神经元相关基因表达

【来源:《华夏医学》编辑部 | 作者:韩君 | 编辑:李佳睿 | 发布日期:2023-01-09】

韩君

北京康仁堂药业有限公司

摘要:目的:探讨TFRC对肝癌HepG2细胞转录组水平的影响,解读其潜在的功能。方法:根据癌症基因组图谱(TCGA)数据分析,发现TFRC与肝癌患者的预后密切相关,采用TFRC敲低的肝癌HepG2细胞和阴性对照肝癌HepG2细胞进行转录组RNA测序,筛选差异表达基因并进行GO注释分析,KEGG富集分析和蛋白互作网络分析。结果:两种HepG2细胞转录组中筛选出869个差异表达基因(DEGs),功能分析发现多个DEGs与血管和神经元调节有关;依据血管和神经元相关的DEGs,构建调控网络,发现TFRC是该网络的节点基因。结论:TFRC是血管和神经元调控的重要基因。

关键词:TFRC;RNA-seq;差异表达基因;血管调节;神经元调控;

DOI:10.19296/j.cnki.1008-2409.2022-05-004

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